2001年2月12日,由美、英、法、德、日和中國(guó)6國(guó)的科學(xué)家共同參與的國(guó)際人類基因組公布了人類基因組圖譜及初步分析結(jié)果。這個(gè)被譽(yù)為生命科學(xué)“登月計(jì)劃”的研究項(xiàng)目取得重大進(jìn)展,為人類揭開自身奧秘奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
今年是“人類基因組計(jì)劃”協(xié)作組發(fā)表人類基因組序列草圖20周年,這一被譽(yù)為生命科學(xué)領(lǐng)域“阿波羅登月計(jì)劃”的國(guó)際大科學(xué)計(jì)劃,也有中國(guó)人的身影:拿下其中不可或缺的“1%”。
盡管只參與了1%的任務(wù),但對(duì)中國(guó)來(lái)說(shuō)意味著一個(gè)重要開端。前不久,在中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所、中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所和華大基因聯(lián)合舉辦的紀(jì)念國(guó)際人類基因組工作草圖繪制和“1%項(xiàng)目”完成座談會(huì)上,與會(huì)院士專家的一個(gè)共同觀點(diǎn)是:不要小看了這1%,正是從這1%起步,使我國(guó)成為世界上少數(shù)幾個(gè)能獨(dú)立完成大型基因組分析的國(guó)家,帶動(dòng)我國(guó)基因組學(xué)研究從追趕到并跑,躋身世界前列。
從此,中國(guó)基因測(cè)序研究走向全球第一梯隊(duì)。
“1%項(xiàng)目”
1953年,英國(guó)科學(xué)家弗朗西斯·克里克和詹姆斯·沃森發(fā)現(xiàn)DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)——由含有四種堿基的脫氧核苷酸連接而成的長(zhǎng)鏈。這4個(gè)“字母”排列組合構(gòu)成了所有物種基因組的“天書”。
如何破譯這部天書,從而了解生命的奧秘?1977年,英國(guó)生物化學(xué)家弗雷德里克·桑格等發(fā)明了末端終止測(cè)序法,標(biāo)志著第一代DNA測(cè)序技術(shù)的誕生。同年,他們測(cè)定了第一個(gè)基因組序列,全長(zhǎng)5375個(gè)堿基的噬菌體X174。自此,人類獲得了窺探生命遺傳密碼的能力。
此后,解碼DNA序列的嘗試就從未停止。
1990年10月,“人類基因組計(jì)劃”在美國(guó)首先啟動(dòng),英、日、法、德相繼參與,組成了國(guó)際“人類基因組計(jì)劃”協(xié)作組,其核心內(nèi)容是測(cè)定人類基因組的全部DNA序列,獲得人類全面認(rèn)識(shí)自我最重要的生物學(xué)信息。
這項(xiàng)被譽(yù)為生命科學(xué)領(lǐng)域“登月計(jì)劃”的“盛宴”,中國(guó)要參與嗎?答案是肯定的。
1994年,中國(guó)“人類基因組計(jì)劃”在談家楨、吳旻、強(qiáng)伯勤、陳竺,以及沈巖、楊煥明等科學(xué)家的倡導(dǎo)下啟動(dòng)。
中科院院士、華大基因聯(lián)合創(chuàng)始人楊煥明至今記得,1997年11月,在湖南張家界舉行的中國(guó)遺傳學(xué)組青年委員會(huì)第一次會(huì)議上,包括他在內(nèi)的許多青年科學(xué)家商議要加入國(guó)際“人類基因組計(jì)劃”,推動(dòng)中國(guó)基因組科學(xué)的發(fā)展。
隨后,在中國(guó)科學(xué)院和國(guó)家南、北方基因組中心同行的支持下,中國(guó)科學(xué)院遺傳所(現(xiàn)遺傳發(fā)育所的部分前身)人類基因組中心在1998年8月成立。按遺傳所原所長(zhǎng)陳受宜的話說(shuō),該中心將“有志于此的人才匯聚一堂”,解決了當(dāng)時(shí)我國(guó)大規(guī)?;蚪M研究“人才匱乏”的窘境。
次年7月7日,國(guó)際“人類基因組計(jì)劃”協(xié)作組公布了中國(guó)加入“人類基因組計(jì)劃”的申請(qǐng),并于同年9月1日正式向全世界宣布,這標(biāo)志著我國(guó)成為美、英、日、法、德之外,第六個(gè) “人類基因組計(jì)劃”的參與國(guó)家,也是唯一的發(fā)展中國(guó)家。
中科院院士、時(shí)任國(guó)家人類基因組南方研究中心執(zhí)行主任趙國(guó)屏介紹,人類基因組包含近兩萬(wàn)個(gè)編碼蛋白質(zhì)的基因,由約30億個(gè)堿基對(duì)組成,分布在細(xì)胞核的23對(duì)染色體之中。中國(guó)在“人類基因組計(jì)劃”中負(fù)責(zé)測(cè)定和分析3號(hào)染色體短臂上從端粒到標(biāo)記D3S3610間大約30厘摩爾(相當(dāng)于3千萬(wàn)個(gè)核苷酸)的區(qū)域,因此被稱為“1%項(xiàng)目”。
“也許‘1%項(xiàng)目’對(duì)整個(gè)項(xiàng)目而言有些微不足道,但它的實(shí)施給我國(guó)基因組學(xué)發(fā)展所帶來(lái)的意義卻是重大的。同時(shí),‘1%項(xiàng)目’也對(duì)社會(huì)公眾進(jìn)行了一次聲勢(shì)浩大的基因及基因組普及教育,為中國(guó)生命科學(xué)研究和生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展開拓了無(wú)限的空間。”趙國(guó)屏說(shuō)。
“中國(guó)印記”
2001年8月26日,中科院遺傳所人類基因組中心和國(guó)家南、北方基因組中心共同完成了“包干”區(qū)域任務(wù)——“1%項(xiàng)目”的基因序列圖譜,相比國(guó)際同行,提前兩年高質(zhì)量完成任務(wù)。
“加入國(guó)際‘人類基因組計(jì)劃’,可以使中國(guó)平等分享該計(jì)劃所建立的所有技術(shù)、資源和數(shù)據(jù),并使我國(guó)成為世界上少數(shù)幾個(gè)能獨(dú)立完成大型基因組分析的國(guó)家。”楊煥明說(shuō)。
2003年4月25日,距離發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋整整半個(gè)世紀(jì)后,歷時(shí)13年,耗資近30億美元的“人類基因組計(jì)劃”宣告完成。
作為人類科學(xué)史上的偉大工程,這一計(jì)劃帶來(lái)了生命科學(xué)的新時(shí)代,在發(fā)展過(guò)程中建立起來(lái)的基因組學(xué)、生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)生物相關(guān)學(xué)科和產(chǎn)業(yè)起到了巨大的推動(dòng)作用,有關(guān)生命科學(xué)的新興技術(shù)和生物產(chǎn)業(yè)如雨后春筍般涌現(xiàn)。
楊煥明告訴記者,中國(guó)科學(xué)家“搶”到“人類基因組計(jì)劃”1%的份額,讓這個(gè)人類科技史的重要里程碑上刻下了“中國(guó)”二字。更重要的是,它還帶動(dòng)了中國(guó)基因測(cè)序技術(shù)從追趕實(shí)現(xiàn)并跑,并在測(cè)序儀的研制和量產(chǎn)以及生物信息學(xué)軟件的開發(fā)等方面逐漸走向全球第一梯隊(duì)。
在他看來(lái),通過(guò)參與這一計(jì)劃,中國(guó)科學(xué)家得以在短時(shí)間內(nèi)學(xué)習(xí)并追趕發(fā)達(dá)國(guó)家的先進(jìn)生物技術(shù),先后完成了水稻基因組、小麥A基因組、SARS冠狀病毒的基因組研究,以及對(duì)熊貓、家豬、家雞、家蠶等動(dòng)物基因組的測(cè)序工作,使我國(guó)的基因組研究得以躋身世界前列。
“高歌猛進(jìn)”
人類基因組草圖發(fā)布20年來(lái),相關(guān)科學(xué)研究突飛猛進(jìn)。隨著基因組測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展,成本也出現(xiàn)了“斷崖式”下跌。
“人類基因組計(jì)劃”在1985年被提出時(shí),可謂是一次“世紀(jì)拍板”:當(dāng)時(shí)無(wú)人知曉測(cè)序究竟要花多少錢,于是按1美元一對(duì)堿基做的“拍腦袋”預(yù)算,總預(yù)算30億美元。計(jì)劃周期為15年,即于2005年完成。
楊煥明說(shuō),當(dāng)?shù)谝粋€(gè)人類基因組被完全解讀后,科學(xué)界的普遍共識(shí)則是迫切需要新的技術(shù)革命。以更低的成本、用更短的時(shí)間和更高的效率來(lái)準(zhǔn)確地測(cè)定每個(gè)人的基因組。如此,基因組學(xué)才有未來(lái)。
如今,自“人類基因組計(jì)劃”以來(lái),DNA測(cè)序技術(shù)的發(fā)展已經(jīng)歷4次歷史性飛躍。
2007年5月,“人類基因組計(jì)劃”完成4年后,“DNA之父”詹姆斯·沃森拿到了世界上首份個(gè)人基因組圖譜。繪制沃森基因組圖譜的“吉姆工程”前后只用了不到兩年時(shí)間,花費(fèi)僅200萬(wàn)美元。
2008年,全基因組測(cè)序的成本降至20萬(wàn)美元。到2010年,該費(fèi)用已經(jīng)可以控制在1萬(wàn)美元以內(nèi)。而據(jù)美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院數(shù)據(jù),到2020年,人類全基因組測(cè)序的成本已降低到1000美元以下。
嘗到“甜頭”后,科學(xué)家的創(chuàng)新熱情持續(xù)高漲,又發(fā)明了第三代單分子測(cè)序技術(shù)、第四代核苷酸測(cè)序技術(shù),可進(jìn)行單條序列長(zhǎng)度更長(zhǎng)、更準(zhǔn)確的測(cè)序。
趙國(guó)屏說(shuō),正是基于四代測(cè)序技術(shù)的“接力賽”,人類基因組序列終于“補(bǔ)齊”,有了更完整的版本。而此前發(fā)表的人類全基因組序列都留有不少“缺口”或“空洞”。
前不久,由加州大學(xué)圣克魯斯分校的卡倫·米加和國(guó)家人類基因組研究所的亞當(dāng)·菲利皮領(lǐng)導(dǎo)的“端粒到端?!甭?lián)盟繪制的新版本基因組新版本,比2001年的版本增加了近兩億個(gè)堿基對(duì)以及2226個(gè)新基因,使人們獲得了約30.55億對(duì)堿基對(duì)的完整信息。這一結(jié)果填補(bǔ)了之前剩余的大部分缺口,是自人類參考基因組首次發(fā)布以來(lái)進(jìn)行的最大改進(jìn)。
2018年9月30日,詹姆斯·沃森等人在《自然》雜志共同撰文指出:“人們常常以為,是先有科學(xué)發(fā)現(xiàn)再有技術(shù)發(fā)明,科學(xué)發(fā)現(xiàn)和技術(shù)發(fā)明存在單向關(guān)系,其實(shí)不然。”
他們認(rèn)為:很多科學(xué)發(fā)現(xiàn)都是由技術(shù)發(fā)明推動(dòng)的。比如,由于玻璃磨制技術(shù)的改進(jìn),發(fā)明出了望遠(yuǎn)鏡,天文學(xué)才得以空前進(jìn)步;再如,萊特兄弟發(fā)明了飛機(jī),其后才有空氣動(dòng)力學(xué)。有了DNA測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步和工具的發(fā)展,基因組科學(xué)才有如此驚人的突破性發(fā)展。
“曙光初現(xiàn)”
20年來(lái),這一破譯“生命天書”劃時(shí)代的成就,給人類對(duì)疾病和物種演化的認(rèn)知帶來(lái)了革命性變化?;驕y(cè)序技術(shù)不斷進(jìn)步,測(cè)序成本以“超摩爾速度”直線下降,新的基因組藥物不斷問(wèn)世,科學(xué)家們解密的致病基因越來(lái)越多。
人類基因組研究院主任埃里克·格林從第一天起就參與了“人類基因組計(jì)劃”,他曾想象有一天基因組學(xué)可能會(huì)成為臨床治療的一部分,“但我真的沒(méi)想到這會(huì)在我有生之年發(fā)生?!?/span>
2010年,科學(xué)家懷揣了數(shù)十年的夢(mèng)想成為現(xiàn)實(shí)。
那一年,罹患罕見(jiàn)致命性腸道感染病的6歲美國(guó)男孩尼古拉斯·沃爾克,成為世界上第一個(gè)被基因測(cè)序技術(shù)拯救的兒童?;驕y(cè)序發(fā)現(xiàn)他有一個(gè)出人意料的基因突變,通過(guò)從臍帶血中取出細(xì)胞進(jìn)行骨髓移植,取得了良好療效。
趙國(guó)屏說(shuō),這一奇跡給了科學(xué)家巨大的信心。近年來(lái),又有多位地中海貧血、白血病患者受益于基因技術(shù)被治愈。這些成果向人們展示了基因科技造福人類的前景。
自2001年開始,每年關(guān)于蛋白編碼基因的學(xué)術(shù)論文數(shù)量在1萬(wàn)篇到兩萬(wàn)篇,很多研究集中在一些“超級(jí)明星基因”上,這對(duì)深入認(rèn)識(shí)重要的基因十分關(guān)鍵。
2001年之前,明確某種藥物全部蛋白靶點(diǎn)的概率不到50%?!叭祟惢蚪M計(jì)劃”完成后,美國(guó)每年通過(guò)的藥物幾乎都有清楚的作用靶點(diǎn)說(shuō)明。
“人類基因組序列就像化學(xué)元素周期表對(duì)化學(xué)一樣重要,可以知道世界是由多少種元素組成。而基因組提供了遺傳信息,人的生、老、病、死都與基因組圖譜密切相關(guān),其重要性不言而喻?!睏顭髡f(shuō)。
他同時(shí)表示,相比未來(lái),生命科學(xué)的組學(xué)時(shí)代才曙光初現(xiàn)。新冠肺炎疫情來(lái)襲也再次提醒人類:我們對(duì)生命的認(rèn)識(shí)還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。要真正破譯生命這本天書,科學(xué)家還需要攜手構(gòu)建生命科學(xué)的“大數(shù)據(jù)”時(shí)代。
來(lái)源:中國(guó)青年報(bào)